食用菌液體菌種發(fā)酵罐在結(jié)構(gòu)上有很多種，幾乎每個廠家的發(fā)酵罐都有一定的區(qū)別，但是可以把食用菌液體菌種發(fā)酵罐分為兩種：移動式發(fā)酵罐和固定式發(fā)酵罐。
移動式發(fā)酵罐： 
可以移動的發(fā)酵罐，發(fā)酵罐整體在滅菌鍋內(nèi)滅菌，滅菌后冷卻、接種后，推入發(fā)酵罐培養(yǎng)室。 
固定式發(fā)酵罐： 
固定在發(fā)酵罐培養(yǎng)室，滅菌、冷卻、接種都是在發(fā)酵罐培養(yǎng)室完成的。 
兩種發(fā)酵罐在結(jié)構(gòu)和工作原理上有很大的區(qū)別，兩者各有其優(yōu)點和缺點，在大家通常知道的這些優(yōu)點和缺點上兩者似乎旗鼓相當，比如： 
移動的發(fā)酵罐在滅菌鍋內(nèi)滅菌，滅菌更容易徹底，不容易出現(xiàn)滅菌“死角”，而固定式發(fā)酵罐用電或者蒸汽既可滅菌，不需要購買專門的滅菌鍋。 
移動式發(fā)酵罐對輪子和地面都有很高的要求，容易損壞地面，而固定式發(fā)酵罐則不存在這些問題。 
正是因為兩者各自的優(yōu)缺點，兩者都在食用菌行業(yè)廣泛使用，不同的生產(chǎn)方式和規(guī)模根據(jù)實際情況采用不同方式的發(fā)酵罐，但是很多人忽略了移動式發(fā)酵罐和固定式發(fā)酵罐最大的區(qū)別。 
兩者最大的區(qū)別： 
移動式發(fā)酵罐是接種后推入發(fā)酵罐培養(yǎng)室的，在培養(yǎng)室?guī)缀鯖]有任何的操作了，因此發(fā)酵罐培養(yǎng)室的環(huán)境和溫度非常穩(wěn)定。 
固定式發(fā)酵罐是在發(fā)酵罐培養(yǎng)室完成滅菌、冷卻、接種的，發(fā)酵罐培養(yǎng)室的環(huán)境和溫度及其不穩(wěn)定，發(fā)酵罐滅菌的溫度是122℃，一定會對兩側(cè)發(fā)酵罐的溫度帶來影響，在滅菌的過程中還會產(chǎn)生廢氣和廢水，影響發(fā)酵罐培養(yǎng)室的環(huán)境。 
也就是說在環(huán)境和溫度的穩(wěn)定性上，移動式發(fā)酵罐要優(yōu)于固定式發(fā)酵罐，這也是大型食用菌工廠普遍采用移動式發(fā)酵罐的原因。  
了解了這一點，并不是一味的選擇移動式發(fā)酵罐，而是要根據(jù)自己的實際情況決定是選擇移動式發(fā)酵罐，還是固定式發(fā)酵罐了。